Материалы доступны только для специалистов сферы здравоохранения. Авторизуйтесь или зарегистрируйтесь.
Особенности состава микробиоты кишечника у пациентов с алкогольным циррозом печени
Особенности состава микробиоты кишечника у пациентов с алкогольным циррозом печени
Шаликиани Н. В., Бакулин И. Г., Дубинкина В. Б., Ищенко Д. С., Алексеев Д. Г., Тяхт А. В., Павленко А. В., Ильина Е. Н., Кострюкова Е. С., Тараскина А. Е., Скородумова Л. О., Маев И. В., Говорун В. М. Особенности состава микробиоты кишечника у пациентов с алкогольным циррозом печени. Терапевтический архив. 2015;87(12):59-65. https://doi.org/10.17116/terarkh2015871259-65
Материалы доступны только для специалистов сферы здравоохранения. Авторизуйтесь или зарегистрируйтесь.
Аннотация
Цель исследования. Установление особенностей таксономического и функционального состава микробиоты кишечника у пациентов с циррозом печени (ЦП) алкогольной этиологии. Материалы и методы. С помощью метагеномного анализа исследован таксономический состав и функциональный потенциал микробиоты кишечника у 20 пациентов с ЦП алкогольной этиологии. Из образцов кала пациентов выделена тотальная ДНК, после чего проведено полногеномное секвенирование. В ходе анализа метагеномных данных получены результаты по относительной таксономической и функциональной представленности микробных видов в исследуемых образцах. Проведен сравнительный анализ с ранее опубликованными наборами метагеномных данных по когортам здорового населения Российской Федерации, а также Дании, Китая и США. Результаты. У большинства пациентов преобладающая часть кишечного сообщества представлена бактериальными видами, составляющими нормофлору кишечника человека. В то же время у ряда пациентов идентифицирован аномальный состав микробиоты кишечника, свидетельствующий о выраженном дисбактериозе. Дополнительно совокупный анализ данных позволил идентифицировать ряд видов со статистически значимо повышенной и пониженной относительной представленностью по сравнению с контрольными группами. Так, в микробиоте кишечника пациентов с ЦП алкогольной этиологии наблюдается повышенное содержание бактерий, характерных для ротовой полости. Анализ совокупного метаболического потенциала микробиоты таких пациентов продемонстрировал повышенную представленность генов ферментов, участвующих в метаболизме этанола (алкоголя). Заключение. Идентифицированные по отдельным бактериальным видам изменения состава микробиоты у пациентов с алкогольным ЦП могут быть связаны с сопутствующими заболеваниями желудочно-кишечного тракта, таких как хронический эрозивный гастрит, хронический панкреатит и язвенная болезнь желудка. Изменения, происходящие при алкогольном циррозе, способствуют проникновению и размножению в кишечнике человека микроорганизмов, характерных для ротовой полости. Это может быть потенциальным биомаркером для диагностики заболеваний печени. Бактериальные гены ферментов, участвующие в метаболизме этанола, обладают повышенной представленностью как в группе пациентов с алкогольным ЦП, так и у здоровых добровольцев из Российской Федерации.
Ключевые слова: алкогольный цирроз, микробиота кишечника, микробиом, сообщество микроорганизмов кишечника, метагеном
Ключевые слова: алкогольный цирроз, микробиота кишечника, микробиом, сообщество микроорганизмов кишечника, метагеном
Полный текст
Список литературы
Авторы
Шаликиани Н.В.1, Бакулин И.Г.2, Дубинкина В.Б.3, Ищенко Д.С.3,4, Алексеев Д.Г.3,4, Тяхт А.В.3,4, Павленко А.В.5, Ильина Е.Н.6, Кострюкова Е.С.4,7, Тараскина А.Е.8,9, Скородумова Л.О.4, Маев И.В.10, Говорун В.М.4,7
1 ГБУЗ «Московский клинический научно-практический центр» Департамента здравоохранения города Москвы, Москва, Россия 2 Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова, Санкт-Петербург, Россия
3 ФГАОУ ВПО «Московский физико-технический институт, Долгопрудный, Россия
4 ФГБУН «НИИ физико-химической медицины ФМБА России, Москва, Россия
5 Московский научно-практический центр дерматовенерологии и косметологии Департамента здравоохранения Москвы, Москва, Россия, 119071
6 Федеральное государственное бюджетное учреждение «Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины» Федерального медико-биологического агентства России, Москва, Россия, 119435
7 ГБОУ ВПО «Казанский (Приволжский) Федеральный Университет» Минобрнауки России, Казань, Россия
8 Санкт-Петербургский научно-исследовательский психоневрологический институт им. В.М. Бехтерева, Санкт-Петербург
9 Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. академика И.П. Павлова, Санкт-Петербург
10 ГБОУ ВПО "Московский государственный медико-стоматологический университет им. А.И. Евдокимова" Минздрава России
Цель портала OmniDoctor – предоставление профессиональной информации врачам, провизорам и фармацевтам.