Формирование полирезистентности у микроорганизмов при проведении антибактериальной терапии в отделениях реанимации многопрофильного стационара в период пандемии COVID-19
Формирование полирезистентности у микроорганизмов при проведении антибактериальной терапии в отделениях реанимации многопрофильного стационара в период пандемии COVID-19
Эсауленко Н.Б., Ткаченко О.В., Казаков С.П., Давыдов Д.В., Зайцев А.А., Чернов С.А. Формирование полирезистентности у микроорганизмов при проведении антибактериальной терапии в отделениях реанимации многопрофильного стационара в период пандемии COVID-19. Consilium Medicum. 2023;25(12):811–816. DOI: 10.26442/20751753.2023.12.202536
Esaulenko NB, Tkachenko OV, Kazakov SP, Davydov DV, Zaytsev AA, Chernov SA. Development of polyresistance in microorganisms during antibiotic therapy during a pandemic COVID-19 in a multidisciplinary hospital. Consilium Medicum. 2023;25(12):811–816. DOI: 10.26442/20751753.2023.12.202536
Формирование полирезистентности у микроорганизмов при проведении антибактериальной терапии в отделениях реанимации многопрофильного стационара в период пандемии COVID-19
Эсауленко Н.Б., Ткаченко О.В., Казаков С.П., Давыдов Д.В., Зайцев А.А., Чернов С.А. Формирование полирезистентности у микроорганизмов при проведении антибактериальной терапии в отделениях реанимации многопрофильного стационара в период пандемии COVID-19. Consilium Medicum. 2023;25(12):811–816. DOI: 10.26442/20751753.2023.12.202536
Esaulenko NB, Tkachenko OV, Kazakov SP, Davydov DV, Zaytsev AA, Chernov SA. Development of polyresistance in microorganisms during antibiotic therapy during a pandemic COVID-19 in a multidisciplinary hospital. Consilium Medicum. 2023;25(12):811–816. DOI: 10.26442/20751753.2023.12.202536
Обоснование. Нерациональное и чрезмерное использование антимикробных препаратов (АМП) создает условия для развития глобального кризиса систем здравоохранения, связанного с антибиотикорезистентностью. Цель. Провести ретроспективное иccледование влияния использования АМП на изменение микробиологического пейзажа и чувствительности микроорганизмов в условиях пандемии новой коронавирусной инфекции (COVID-19) в 2020–2021 гг. в отделениях реанимации и интенсивной терапии (ОРИТ) многопрофильного стационара. Материалы и методы. Проведено сравнение выделенных от больных и с поверхностей внутрибольничной среды штаммов микроорганизмов по такому показателю, как изменение их чувствительности к значимым группам АМП в ОРИТ для соматических и инфекционных больных с COVID-19. Чувствительность изолятов оценивали в соответствии с критериями Европейского комитета по определению чувствительности к АМП (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing – EUCAST), версия 10.0, 2020. Результаты. Всего изучено 1394 изолята, из которых 1379 – клинические, 15 – с поверхностей госпитальной среды. Обнаружено, что во всех ОРИТ в 2020–2021 гг. в инфекционных локусах более чем в 70% случаев превалировали грамотрицательные микроорганизмы. В 2021 г. в ОРИТ у инфекционных больных с COVID-19 выявлено стойкое доминирование микроорганизма Acinetobacter baumannii с нарастанием количества поли- и панрезистентных штаммов до 48,7%, в то время как в ОРИТ для соматических больных среди грамотрицательных микроорганизмов преобладала Klebsiella pneumoniae, удельный вес которой в 2020 г. составил 37,5%, в 2021 г. – 43,7%. Показано, что в одном или в смежных отделениях лечебного учреждения на протяжении времени могут фигурировать нозокомиальные микроорганизмы, отличающиеся набором генов резистентности и чувствительностью к АМП. Заключение. Обоснована необходимость ведения постоянного микробиологического мониторинга и паспорта лечебного отделения с обязательной регистрацией не только выделенных штаммов микроорганизмов, но и генов резистентности в целях назначения своевременной адекватной эмпирической антимикробной терапии. Период проведения последней должен быть максимально коротким и подтверждаться убедительными клиническими признаками бактериального инфицирования, а впоследствии – выделением от больных нозокомиальной флоры из биоматериала критических локусов.
Background. Irrational and excessive use of antimicrobials drugs (AMD) creates conditions for the development of a global crisis of health systems around the world associated with antibiotic resistance. Aim. To conduct a retrospective study of the impact of the use of AMD on the change in the microbiological landscape and the sensitivity of microorganisms in the conditions of pandemic of the new coronavirus infection (COVID-19) in 2020–2021 in intensive care departments (ICD) of a multidisciplinary hospital. Materials and methods. In the course of the work, strains of microorganisms isolated from patients and from the surfaces of the hospital environment and changes in their sensitivity to significant groups of AMD in ICD for somatic and infectious patients with COVID-19 were compared. The sensitivity of the isolates was evaluated in accordance with the criteria of requirements of European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing – EUCAST, version 10.0, 2020. Results. A total of 1,394 isolates were studied, including 1,379 clinical and 15 isolates from the surfaces of the hospital environment. It was found that in all ICD in 2020–2021, gram-negative microorganisms prevailed in infectious loci in 70% of cases or more. In 2021, in the ICD in infectious patients with COVID-19, the persistent dominance of the Acinetobacter baumannii microorganism was revealed with an increase in the number of poly- and pan-resistant strains – 48.7%. While in the ICD for somatic patients Klebsiella Pneumoniae prevailed among gram-negative microorganisms – 37.5% in 2020 and 43.7% in 2021. It has been shown that in one department or in adjacent departments of the same medical institution, various nosocomial microorganisms with an unequal set of resistance genes and sensitivity to AMD may appear over time. Conclusion. The necessity of conducting constant microbiological monitoring and a passport of the medical department with mandatory registration of not only isolated strains of microorganisms, but also resistance genes in order to optimize the appointment of timely adequate empirical antimicrobial therapy is substantiated. The period of the latter should be as short as possible, and confirmed by convincing clinical signs of bacterial infection, and subsequently by the isolation of nosocomial flora from the biomaterial of critical loci from patients.
1. Abraham EP, Chain E. An enzyme from bacteria able to destroy penicillin. 1940. Rev Infect Dis. 1988;10(4):677-8.
2. Antimicrobial resistance. WHO Newsletter, 17 November 2021. Available at: https://www.who.int. Accessed: 29.08.2023.
3. О Стратегии предупреждения распространения антимикробной резистентности в РФ на период до 2030 г.: распоряжение Правительства РФ от 25.09.2017 г. № 2045-р. Режим доступа: https://www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/71677266. Ссылка активна на 29.08.2023 [O Strategii preduprezhdeniia rasprostraneniia antimikrobnoi rezistentnosti v RF na period do 2030 g.: rasporiazhenie Pravitel'stva RF ot 25.09.2017 g. № 2045-r. Available at: https://www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/71677266. Accessed: 29.08.2023 (in Russian)].
4. Проект Глобальных исследований устойчивости к противомикробным препаратам (GRAM). Режим доступа: https://www.tropicalmedicine.ox.ac.uk/research/oxford/microbe/gram-project. Ссылка активна на 29.08.2023 [Proekt Global'nykh issledovanii ustoichivosti k protivomikrobnym preparatam (GRAM). Available at: https://www.tropicalmedicine.ox.ac.uk/research/oxford/microbe/gram-project. Accessed: 29.08.2023 (in Russian)].
5. Antimicrobial Resistance Collaborators. Global burden of bacterial antimicrobial resistance in 2019: a systematic analysis. Lancet. 2022;399(10325):629-55.
DOI:10.1016/S0140-6736(21)02724-0
6. WHO publishes list of bacteria for which new antibiotics are urgently needed. 27 February. News release. Geneva. Available at: https://www.who.int/ru/news/item/27-02-2017-who-publishes-list-of-bacteria-for-which-new-antibiotics.... Accessed: 29.08.2023.
7. Pelfrene E, Botgros R, Cavaleri M. Antimicrobial multidrug resistance in the era of COVID-19: a forgotten plight? Antimicrob Resist Infect Control. 2021;10(1):21.
DOI:10.1186/s13756-021-00893-z
8. Яковлев С.В., Суворова М.П., Белобородов В.Б., и др. Распространенность и клиническое значение нозокомиальных инфекций в лечебных учреждениях России: исследование ЭРГИНИ. Антибиотики и химиотерапия. 2016;61(5-6):32-42 [Yakovlev SV, Suvorova MP, Beloborodov VB, et al. Multicentre Study of the Prevalence and Clinical Value of Hospital-Acquired Infections in Emergency Hospitals of Russia: ERGINI Study Team. Antibiot Khimioter. 2016;61(5-6):32-42 (in Russian)].
9. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., и др. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования «МАРАФОН» 2013–2014. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017;19(1):42-8 [Sukhorukova MV, Edelstein MV, Skleenova EYu, et al. Antimicrobial resistance of nosocomial Acinetobacter spp. isolates in Russia: results of multicenter epidemiological study “MARATHON” 2013–2014. Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy. 2017;19(1):42-8 (in Russian)].
10. Эсауленко Н.Б., Ткаченко О.В., Казаков С.П. Исследование особенностей микробного пейзажа и резистентности микроорганизмов у больных COVID-19. Медицинский вестник ГВКГ им. Н.Н. Бурденко. 2021;2(4):54-8 [Esaulenko NB, Tkachenko OV, Kazakov SP. The study features the microbial landscape and resistance of microorganism in COVID-19 patients. Medical Bulletin of the Main Military Clinical Hospital named after N.N. Burdenko. 2021; 2(4):54-58 (in Russian)].
11. Малеев В.В., Зайцев А.А., Яковлев С.В., и др. О применении антибактериальной терапии у пациентов с новой коронавирусной инфекцией COVID-19. Режим доступа: https://www.rmj.ru/news/o-primenenii-antibakterialnoy-terapii-u-patsientov-s-novoy-koronavirusnoy-in.... Ссылка активна на 29.08.2023 [Maleev VV, Zaitsev AA, Iakovlev SV, et al. O primenenii antibakterial'noi terapii u patsientov s novoi koronavirusnoi infektsiei COVID-19. Available at: https://www.rmj.ru/news/o-primenenii-antibakterialnoy-terapii-u-patsientov-s-novoy-koronavirusnoy-in.... Accessed: 29.08.2023 (in Russian)].
12. Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19): временные методические рекомендации. Версия 16 (18.08.2022). М.: Минздрав РФ, 2022 [Profilaktika, diagnostika i lechenie novoi koronavirusnoi infektsii (COVID-19): vremennye metodicheskie rekomendatsii. Versiia 16 (18.08.2022). Moscow: Minzdrav RF, 2022 (in Russian)].
13. Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам (2021): рекомендации МАКМАХ Режим доступа: https://www.antibiotic.ru/minzdrav/category/clinical-recommendations. Ссылка активна на 29.08.2023 [Opredelenie chuvstvitel'nosti mikroorganizmov k antimikrobnym preparatam (2021): rekomendatsii MAKMAKh. Available at: https://www.antibiotic.ru/minzdrav/category/clinical-recommendations. Accessed: 29.08.2023 (in Russian)].
14. Методы санитарно-бактериологических исследований объектов окружающей среды, воздуха и контроля стерильности в лечебных организациях: методические указания. Режим доступа: https://base.garant.ru/4193968. Ссылка активна на 29.08.2023 [Metody sanitarno-bakteriologicheskikh issledovanii ob"ektov okruzhaiushchei sredy, vozdukha i kontrolia steril'nosti v lechebnykh organizatsiiakh: metodicheskie ukazaniia. Available at: https://base.garant.ru/4193968. Accessed: 29.08.2023 (in Russian)].
15. Browne AJ, Chipeta MG, Haines-Woodhous G, et al. Global antibiotic consumption and usage in humans, 2000-18: a spatial modeling study. Lancet Planet Health.
2021;5(12):e893-e904. DOI:10.1016/S2542-5196(21)00280-1
16. Иванов А.А., Куличенко Т.В. Candida auris: проблемы диагностики и лечения. Вопросы современной педиатрии. 2020;19(1):20-5 [Ivanov AA, Kuluchenko TV. Candida auris: Problems in Diagnostics and Management. Current Pediatrics. 2020;19(1):2025 (in Russian)]. DOI:10.15690/vsp.v19i1.2081
17. WHO. The Sixty-eighth World Health Assembly. Strengthening emergency and essential surgical care and anaesthesia as a component of universal health coverage. Geneva; 2015. Available at: https://apps.who.int/gb/ebwha/pdf_files/WHA68-REC1/A68_2015_REC1-ru.pdf. Accessed: 29.08.2023.
18. Эсауленко Н.Б., Каменева О.А., Косякова К.Г., и др. Нозокомиальные инфекции и микробиологический мониторинг в многопрофильных лечебных учреждениях. Медицинский алфавит. 2018;2(35):14-9 [Esaulenko NB, Kameneva OA, Kosyakova KG, et al. Nosocomial infections and microbiological monitoring in multidisciplinary medical institutions. Medical alphabet. 2018;2(35):14-9 (in Russian)].
19. Маркелова Н.Н., Семенова Е.Ф. Возможные пути преодоления антибиотикорезистентности нозокомиальных патогенов Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Stenotrophomonas maltophilia. Антибиотики и химиотерапия. 2018;63(11-12):45-54 [Markelova NN, Semenova EF. Possible Ways to Overcome Antibiotic Resistance of Nosocomial Pathogens Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Stenotrophomonas maltophilia. Antibiotics and Chemotherapy. 2018;63(11-12):45-54 (in Russian)].
20. Диагностика и антимикробная терапия инфекций, вызванных полирезистентными штаммами микроорганизмов: методические рекомендации. Режим доступа: https://association-ar.ru/wp-content/uploads/2022/03/МР-АБТ.pdf. Ссылка активна на 29.08.2023 [Diagnostika i antimikrobnaia terapiia infektsii, vyzvannykh polirezistentnymi shtammami mikroorganizmov: metodicheskie rekomendatsii. Available at: https://association-ar.ru/wp-content/uploads/2022/03/MR-ABT.pdf. Accessed: 29.08.2023 (in Russian)].
21. Синопальников А.И., Зайцев А.А. Медленно разрешающаяся/неразрешающаяся внебольничная пневмония. РМЖ. 2009;17(5):361-7 [Sinopalnikov AI, Zaitsev AA. Slowly resolving/non-resolving community-acquired pneumonia. RMJ. 2009;17(5):361-7 (in Russian)].
22. Кучмин А.Н., Акимкин В.Г., Синопальников А.И., и др. Диагностика, лечение и профилактика внебольничной пневмонии у военнослужащих МО РФ: методические указания. M. 2010 [Kuchmin AN, Akimkin VG, Sinopal'nikov AI, et al. Diagnostika, lechenie i profilaktika vnebol'nichnoi pnevmonii u voennosluzhashchikh MO RF: metodicheskie ukazaniia. Moscow. 2010 (in Russian)].
________________________________________________
1. Abraham EP, Chain E. An enzyme from bacteria able to destroy penicillin. 1940. Rev Infect Dis. 1988;10(4):677-8.
2. Antimicrobial resistance. WHO Newsletter, 17 November 2021. Available at: https://www.who.int. Accessed: 29.08.2023.
3. O Strategii preduprezhdeniia rasprostraneniia antimikrobnoi rezistentnosti v RF na period do 2030 g.: rasporiazhenie Pravitel'stva RF ot 25.09.2017 g. № 2045-r. Available at: https://www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/71677266. Accessed: 29.08.2023 (in Russian).
4. Proekt Global'nykh issledovanii ustoichivosti k protivomikrobnym preparatam (GRAM). Available at: https://www.tropicalmedicine.ox.ac.uk/research/oxford/microbe/gram-project. Accessed: 29.08.2023 (in Russian).
5. Antimicrobial Resistance Collaborators. Global burden of bacterial antimicrobial resistance in 2019: a systematic analysis. Lancet. 2022;399(10325):629-55.
DOI:10.1016/S0140-6736(21)02724-0
6. WHO publishes list of bacteria for which new antibiotics are urgently needed. 27 February. News release. Geneva. Available at: https://www.who.int/ru/news/item/27-02-2017-who-publishes-list-of-bacteria-for-which-new-antibiotics.... Accessed: 29.08.2023.
7. Pelfrene E, Botgros R, Cavaleri M. Antimicrobial multidrug resistance in the era of COVID-19: a forgotten plight? Antimicrob Resist Infect Control. 2021;10(1):21.
DOI:10.1186/s13756-021-00893-z
8. Yakovlev SV, Suvorova MP, Beloborodov VB, et al. Multicentre Study of the Prevalence and Clinical Value of Hospital-Acquired Infections in Emergency Hospitals of Russia: ERGINI Study Team. Antibiot Khimioter. 2016;61(5-6):32-42 (in Russian).
9. Sukhorukova MV, Edelstein MV, Skleenova EYu, et al. Antimicrobial resistance of nosocomial Acinetobacter spp. isolates in Russia: results of multicenter epidemiological study “MARATHON” 2013–2014. Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy. 2017;19(1):42-8 (in Russian).
10. Esaulenko NB, Tkachenko OV, Kazakov SP. The study features the microbial landscape and resistance of microorganism in COVID-19 patients. Medical Bulletin of the Main Military Clinical Hospital named after N.N. Burdenko. 2021; 2(4):54-58 (in Russian).
11. Maleev VV, Zaitsev AA, Iakovlev SV, et al. O primenenii antibakterial'noi terapii u patsientov s novoi koronavirusnoi infektsiei COVID-19. Available at: https://www.rmj.ru/news/o-primenenii-antibakterialnoy-terapii-u-patsientov-s-novoy-koronavirusnoy-in.... Accessed: 29.08.2023 (in Russian).
12. Profilaktika, diagnostika i lechenie novoi koronavirusnoi infektsii (COVID-19): vremennye metodicheskie rekomendatsii. Versiia 16 (18.08.2022). Moscow: Minzdrav RF, 2022 (in Russian).
13. Opredelenie chuvstvitel'nosti mikroorganizmov k antimikrobnym preparatam (2021): rekomendatsii MAKMAKh. Available at: https://www.antibiotic.ru/minzdrav/category/clinical-recommendations. Accessed: 29.08.2023 (in Russian).
14. Metody sanitarno-bakteriologicheskikh issledovanii ob"ektov okruzhaiushchei sredy, vozdukha i kontrolia steril'nosti v lechebnykh organizatsiiakh: metodicheskie ukazaniia. Available at: https://base.garant.ru/4193968. Accessed: 29.08.2023 (in Russian).
15. Browne AJ, Chipeta MG, Haines-Woodhous G, et al. Global antibiotic consumption and usage in humans, 2000-18: a spatial modeling study. Lancet Planet Health.
2021;5(12):e893-e904. DOI:10.1016/S2542-5196(21)00280-1
16. Ivanov AA, Kuluchenko TV. Candida auris: Problems in Diagnostics and Management. Current Pediatrics. 2020;19(1):2025 (in Russian). DOI:10.15690/vsp.v19i1.2081
17. WHO. The Sixty-eighth World Health Assembly. Strengthening emergency and essential surgical care and anaesthesia as a component of universal health coverage. Geneva; 2015. Available at: https://apps.who.int/gb/ebwha/pdf_files/WHA68-REC1/A68_2015_REC1-ru.pdf. Accessed: 29.08.2023.
18. Esaulenko NB, Kameneva OA, Kosyakova KG, et al. Nosocomial infections and microbiological monitoring in multidisciplinary medical institutions. Medical alphabet. 2018;2(35):14-9 (in Russian).
19. Markelova NN, Semenova EF. Possible Ways to Overcome Antibiotic Resistance of Nosocomial Pathogens Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Stenotrophomonas maltophilia. Antibiotics and Chemotherapy. 2018;63(11-12):45-54 (in Russian).
20. Diagnostika i antimikrobnaia terapiia infektsii, vyzvannykh polirezistentnymi shtammami mikroorganizmov: metodicheskie rekomendatsii. Available at: https://association-ar.ru/wp-content/uploads/2022/03/MR-ABT.pdf. Accessed: 29.08.2023 (in Russian).
21. Sinopalnikov AI, Zaitsev AA. Slowly resolving/non-resolving community-acquired pneumonia. RMJ. 2009;17(5):361-7 (in Russian).
22. Kuchmin AN, Akimkin VG, Sinopal'nikov AI, et al. Diagnostika, lechenie i profilaktika vnebol'nichnoi pnevmonii u voennosluzhashchikh MO RF: metodicheskie ukazaniia. Moscow. 2010 (in Russian).
1ФГБУ «Главный военный клинический госпиталь им. академика Н.Н. Бурденко» Минобороны России, Москва, Россия; 2ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России, Москва, Россия; 3ФГБОУ ВО «Российский биотехнологический университет (РОСБИОТЕХ)», Москва, Россия; 4ФГБОУ ВО «Российский университет медицины» Минздрава России, Москва, Россия
*back.lab@yandex.ru
________________________________________________
Nikolay B. Esaulenko*1, Olga V. Tkachenko1, Sergey P. Kazakov1,2, Denis V. Davydov1, Andrey A. Zaytsev1,3,4, Sergey A. Chernov1
1Burdenko Main Military Clinical Hospital, Moscow, Russia; 2Russian Medical Academy of Continuous Professional Education, Moscow, Russia; 3BIOTECH University, Moscow, Russia; 4Russian University of Medicine, Moscow, Russia
*back.lab@yandex.ru