Alymenko MA, Valiev RSh, Valiev NR, Balobanova NP, Batishchev AV, Tragira IN, Lipatov VA, Polonikov AV, Kolomiets VM, Volkova SN, Mal GS, Ragulina VA. Association of genotypes of biotransformation enzymes with susceptibility to chronic pulmonary tuberculosis. Consilium Medicum. 2024;26(3):193–198.
DOI: 10.26442/20751753.2024.3.202659
Ассоциация генотипов ферментов биотрансформации ксенобиотиков с восприимчивостью к торпидно-текущему туберкулезу легких
Alymenko MA, Valiev RSh, Valiev NR, Balobanova NP, Batishchev AV, Tragira IN, Lipatov VA, Polonikov AV, Kolomiets VM, Volkova SN, Mal GS, Ragulina VA. Association of genotypes of biotransformation enzymes with susceptibility to chronic pulmonary tuberculosis. Consilium Medicum. 2024;26(3):193–198.
DOI: 10.26442/20751753.2024.3.202659
Обоснование. В настоящее время известно, что туберкулез легких (ТЛ) является мультифакториальным заболеванием, в формировании которого определенную роль играют как факторы внешней среды, так и генетические факторы. Цель. Провести ассоциацию генов ферментов биотрансформации ксенобиотиков – ФБК: NAT2 [590G>A (rs1799930)], CYP2E1 [9896C>G (rs2070676)], ABCB1 [3435T>C (rs1045642)], GSTM1 (E/D) и GSTT1 (E/D) с восприимчивостью к торпидно-текущему ТЛ. Материалы и методы. В исследование включили 123 человека с торпидно-текущим ТЛ. Выделение геномной ДНК осуществляли с помощью наборов реагентов Arrow Blood DNA 500 из цельной крови (на станции NorDiag Arrow). Далее проводили постановку полимеразной цепной реакции в режиме реального времени с использованием наборов реагентов для генотипирования SNPs. Результаты. Показана ассоциация полиморфизмов генов ФБК с восприимчивостью к торпидно-текущему ТЛ, в том числе к определенным клиническим формам ТЛ. Заключение. Установлено, что необходимо внедрение результатов генотипирования ФБК в практику врача-фтизиатра с целью формирования групп риска больных ТЛ, у которых имеется вероятность восприимчивости к данному заболеванию, что, возможно, в будущем обеспечит индивидуализированный подход к профилактике и лечению данных пациентов.
Background. Now it is well-known that the pulmonary tuberculosis is a multifactorial disease in which forming a certain role belongs as factors external the environment, and genetic to factors. Aim. In this study, the association of genes of xenobiotic biotransformation enzymes: NAT2 [590G>A (rs1799930)], CYP2E1 [9896C>G (rs2070676)], ABCB1 [3435T>C (rs1045642)], GSTM1 (E/D) and GSTT1 (E/D) with susceptibility to torpid pulmonary tuberculosis was carried out. Materials and methods. 123 people suffering from torpid pulmonary tuberculosis were included in the study. Genomic DNA was isolated using Arrow Blood DNA 500 reagent kits from whole blood (at the NorDiag Arrow station). Next, the polymerase chain reaction was staged in real time using sets of reagents for SNPs genotyping. Results. The study showed an association of gene polymorphisms of xenobiotic biotransformation enzymes with susceptibility to torpid pulmonary tuberculosis, including certain clinical forms of pulmonary tuberculosis. Conclusion. During the conducted research it was established that implementation of results of genotyping of enzymes of biotransformation of xenobiotics in practice of the doctor of the phthisiatrician for the purpose of forming of risk groups of suffering from tuberculosis lungs which have a susceptibility probability to this disease that perhaps in the future will provide the individualized approach to prevention and treatment of these patients is necessary.
Keywords: enzymes of biotransformation of xenobiotics, chronic pulmonary tuberculosis, polymorphism of genes, susceptibility
1. Туберкулез у взрослых. Клинические рекомендации. 2022 г. [Tuberkulez u vzroslykh. Klinicheskie rekomendatsii. 2022 g. (in Russian)].
2. Можокина Г.Н., Казаков А.В., Елистратова Н.А., Попов С.А. Ферменты биотрансформации ксенобиотиков и персонификация режимов лечения больных туберкулезом. Туберкулез и болезни легких. 2016;94(4):6-12 [Mozhokina GN, Kazakov AV, Elistratova NA, Popov SA. Biotransformation enzymes for xenobiotics and personalization of treatment regimens for tuberculosis patients. Tuberculosis and Lung Diseases. 2016;94(4):6-12 (in Russian)]. DOI:10.21292/2075-1230-2016-94-4-6-12
3. Белушкина Н.Н., Чемезов А.С., Пальцев М.А. Генетические исследования мультифакториальных заболеваний в концепции персонализированной медицины. Профилактическая медицина. 2019;22(3):26-30 [Belushkina NN, Chemezov AS, Pal'tsev MA. Genetic studies of multifactorial diseases in the concept of personalized medicine. Profilakticheskaya Meditsina. 2016;94(4):6-12 (in Russian)]. DOI:10.17116/profmed20192203126
4. Ozhegova DS, Freidin MB, Pusyrev VP. Using the bioinformatic tools to choose the SNPs with highly possible phenotypic effect. Eur J Hum Gen. 2008;16:397.
5. Рембовский В.Р., Могиленкова Л.А. Процессы детоксикации при воздействии химических веществ на организм. СПб. 2017 [Rembovskii VR, Mogilenkova LA. Protsessy detoksikatsii pri vozdeistvii khimicheskikh veshchestv na organizm. Saint Petersburg. 2017 (in Russian)].
6. Щербо С.Н., Щербо Д.С., Соколова Н.А., и др. Генетическая предрасположенность и устойчивость к некоторым инфекционным заболеваниям. IV. Туберкулез. Медицинский алфавит. 2022;1(6):7-10 [Shcherbo SN, Shcherbo DS, Sokolova NA. Genetic predisposition and resistance to certain infectious diseases. IV. Tuberculosis. Medical alphabet. 2022;1(6):7-10 (in Russian)]. DOI:10.33667/2078-5631-2022-6-7-10
7. Юнусбаева М.М., Карунас А.С., Бикмаева А.Р., и др. Исследование полиморфных локусов ряда генов цитокинов (TNFA, IL1B, IL1RA) и генов детоксикации ксенобиотиков (CYP1A1, CYP2E1, GSTM1) у больных инфильтративным туберкулезом легких. Пульмонология. 2008;(3):59-63 [Yunusbaeva MM, Karunas AS, Bikmaeva AR, et al. Genetic analysis of polymorphic loci of cytokine genes (TNFA, IL1B, IL1RA) and genes of detoxification (CYP1A1, CYP2E1, GSTM1) in patients with infiltrative pulmonary tuberculosis. Pulmonologiya. 2008;(3):59-63 (in Russian)]. DOI:10.18093/0869-0189-2008-0-3-59-63
8. Забродский П.Ф., Мандыч В.Г. Иммунотоксикология ксенобиотиков: монография. Саратов. 2007 [Zabrodskii PF, Mandych VG. Immunotoksikologiia ksenobiotikov: мonografiia. Saratov. 2007 (in Russian)].
9. Алыменко М.А., Валиев Р.Ш., Валиев Н.Р., и др. Ассоциация полиморфных вариантов генов ферментов биотрансформации ксенобиотиков и цитокинов с деструкцией легочной ткани у больных туберкулезом. Туберкулез и болезни легких. 2022;100(8):25-30 [Alymenko MA, Valiev RSh, Valiev NR, et al. Association of Polymorphic Gene Variants of Xenobiotic Biotransformation Enzymes with Lung Tissue Destruction in Tuberculosis Patients. Tuberculosis and Lung Diseases. (in Russian)].
DOI:10.21292/2075-1230-2022-100-8-25-30
10. Алыменко М.А., Валиев Р.Ш., Полоников А.В., и др. Ассоциация полиморфных вариантов генов ферментов биотрансформации ксенобиотиков с восприимчивостью к заболеваемости туберкулезом легких. Туберкулез и болезни легких. 2022;100(6):17-22 [Alymenko MA, Valiev RSh, Polonikov AV, et al. Association of polymorphic gene variants of xenobiotic biotransformation enzymes with susceptibility to pulmonary tuberculosis. Tuberculosis and Lung Diseases. 2022;100(6):17-22 (in Russian)].
DOI:10.21292/2075-1230-2022-100-6-17-22
________________________________________________
1. Tuberkulez u vzroslykh. Klinicheskie rekomendatsii. 2022 g. (in Russian).
2. Mozhokina GN, Kazakov AV, Elistratova NA, Popov SA. Biotransformation enzymes for xenobiotics and personalization of treatment regimens for tuberculosis patients. Tuberculosis and Lung Diseases. 2016;94(4):6-12 (in Russian). DOI:10.21292/2075-1230-2016-94-4-6-12
3. Belushkina NN, Chemezov AS, Pal'tsev MA. Genetic studies of multifactorial diseases in the concept of personalized medicine. Profilakticheskaya Meditsina. 2016;94(4):6-12 (in Russian). DOI:10.17116/profmed20192203126
4. Ozhegova DS, Freidin MB, Pusyrev VP. Using the bioinformatic tools to choose the SNPs with highly possible phenotypic effect. Eur J Hum Gen. 2008;16:397.
5. Rembovskii VR, Mogilenkova LA. Protsessy detoksikatsii pri vozdeistvii khimicheskikh veshchestv na organizm. Saint Petersburg. 2017 (in Russian).
6. Shcherbo SN, Shcherbo DS, Sokolova NA. Genetic predisposition and resistance to certain infectious diseases. IV. Tuberculosis. Medical alphabet. 2022;1(6):7-10 (in Russian). DOI:10.33667/2078-5631-2022-6-7-10
7. Yunusbaeva MM, Karunas AS, Bikmaeva AR, et al. Genetic analysis of polymorphic loci of cytokine genes (TNFA, IL1B, IL1RA) and genes of detoxification (CYP1A1, CYP2E1, GSTM1) in patients with infiltrative pulmonary tuberculosis. Pulmonologiya. 2008;(3):59-63 (in Russian). DOI:10.18093/0869-0189-2008-0-3-59-63
8. Zabrodskii PF, Mandych VG. Immunotoksikologiia ksenobiotikov: мonografiia. Saratov. 2007 (in Russian).
9. Alymenko MA, Valiev RSh, Valiev NR, et al. Association of Polymorphic Gene Variants of Xenobiotic Biotransformation Enzymes with Lung Tissue Destruction in Tuberculosis Patients. Tuberculosis and Lung Diseases. (in Russian). DOI:10.21292/2075-1230-2022-100-8-25-30
10. Alymenko MA, Valiev RSh, Polonikov AV, et al. Association of polymorphic gene variants of xenobiotic biotransformation enzymes with susceptibility to pulmonary tuberculosis. Tuberculosis and Lung Diseases. 2022;100(6):17-22 (in Russian). DOI:10.21292/2075-1230-2022-100-6-17-22
1Казанская государственная медицинская академия – филиал ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России, Казань, Россия; 2НОЧУ ВО «Московский финансово-промышленный университет «Синергия», Москва, Россия; 3ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний» Минздрава России, Москва, Россия; 4ФГБОУ ВО «Курский государственный медицинский университет» Минздрава России, Курск, Россия; 5ФГБОУ ВО «Курский государственный аграрный университет им. И.И. Иванова», Курск, Россия
*maxim.alymenko@gmail.com
________________________________________________
Maxim A. Alymenko*1,2, Ravil Sh. Valiev1, Nail R. Valiev1, Natalya P. Balobanova2, Alexander V. Batishchev2, Irina N. Tragira3, Viacheslav A. Lipatov4, Alexey V. Polonikov4, Vladislav M. Kolomiets4, Svetlana N. Volkova5, Galina S. Mal4, Vera A. Ragulina4
1Kazan State Medical Academy – Branch Campus of the Russian Medical Academy of Continuous Professional Education, Kazan, Russia; 2Moscow Financial and Industrial University „Synergy“, Moscow, Russia; 3National Medical Research Center of Tuberculosis and Infectious Diseases, Moscow, Russia; 4Kursk State Medical University, Kursk, Russia; 5Ivanov Kursk State Agrarian University, Kursk, Russia
*maxim.alymenko@gmail.com