Материалы доступны только для специалистов сферы здравоохранения. Авторизуйтесь или зарегистрируйтесь.
Клинико-диагностическая ценность включения ПЦР-исследования крови в традиционный алгоритм идентификации возбудителей инфекционного эндокардита: когортное исследование 124 пациентов
Клинико-диагностическая ценность включения ПЦР-исследования крови в традиционный алгоритм идентификации возбудителей инфекционного эндокардита: когортное исследование 124 пациентов
Котова Е.О., Домонова Э.А., Кобалава Ж.Д., Моисеева А.Ю., Писарюк А.С., Сильвейстрова О.Ю., Караулова Ю.Л., Акимкин В.Г. Клинико-диагностическая ценность включения ПЦР-исследования крови в традиционный алгоритм идентификации возбудителей инфекционного эндокардита: когортное исследование 124 пациентов. Терапевтический архив. 2023;95(1):23–31.
DOI: 10.26442/00403660.2023.01.202042
© ООО «КОНСИЛИУМ МЕДИКУМ», 2023 г.
DOI: 10.26442/00403660.2023.01.202042
© ООО «КОНСИЛИУМ МЕДИКУМ», 2023 г.
________________________________________________
Материалы доступны только для специалистов сферы здравоохранения. Авторизуйтесь или зарегистрируйтесь.
Аннотация
При подозрении на инфекционный эндокардит (ИЭ) определение этиологии имеет принципиальное значение для верификации заболевания и назначения эффективной терапии. Микробиологические методы диагностики являются основными, но зачастую они должны быть дополнены исследованиями, независимыми от культуральных свойств выявляемых патологических агентов.
Цель. Изучение диагностического преимущества и ценности параллельного внедрения молекулярно-биологических методов (полимеразная цепная реакция – ПЦР, секвенирование) в дополнение к микробиологическому исследованию образцов цельной венозной крови при ИЭ.
Материалы и методы. Обследованы 124 пациента с достоверным или вероятным ИЭ (DUKE 2015), госпитализированных в ГБУЗ «ГКБ им. В.В. Виноградова» (2015–2021 гг.). Всем пациентам проводилось параллельное микробиологическое (культуральное) и молекулярно-биологическое (ПЦР или ПЦР с последующим секвенированием) исследования образцов цельной венозной крови.
Результаты. Внедрение раннего параллельного ПЦР-исследования в алгоритм этиологической диагностики ИЭ позволило получить дополнительное преимущество у 43/124 (34,7%) пациентов, позволившее исключить недостоверные результаты при определении комменсалов кожных покровов CoNS и нетипичных для ИЭ патогенов или контаминацию и идентифицировать истинные возбудители, а также впервые выделить этиопатогенетического возбудителя при отрицательном микробиологическом исследовании. Показано, что при ИЭ, ассоциированном с CoNS, связь с заболеванием подтверждена при ПЦР-исследовании у 21,4% (3/14) и опровергнута у 71,4% (10/14) пациентов. Совпадение результатов микробиологического и ПЦР-исследования образцов крови получено только у 35/95 (36,8%) больных. Положительные результаты ПЦР-исследования крови биологического материала при отрицательных результатах культурального исследования получены у 22/51 (43,1%) пациентов, из них у 2/22 (9,0%) удалось подтвердить наличие ДНК Bartonella spp. Представленный комплексный алгоритм позволил значительно увеличить возможность прижизненной идентификации возбудителя в крови от 58,9 до 76,6%. ИЭ с неустановленной этиологией имелся у 29/124 (23,4%) обследованных. Параллельное ПЦР-исследование позволило провести своевременную коррекцию антибактериальной терапии у 43/124 (34,7%) пациентов.
Заключение. Обоснованно расширение показаний для применения ПЦР-исследования, в первую очередь образцов цельной венозной крови, не только при ИЭ с отрицательными результатами микробиологического исследования, но и в качестве метода-контроля за достоверностью получаемых результатов традиционных (культуральных) методов диагностики.
Ключевые слова: инфекционный эндокардит, микробиологические методы диагностики, культуральное исследование, полимеразная цепная реакция, молекулярно-биологические методы, ПЦР, секвенирование, этиологическая диагностика
Aim. To investigate of the diagnostic advantage and value of quantitative analysis of molecular biological methods (polymerase chain reaction – PCR, sequencing) in addition to microbiological examination of whole venous blood in IE.
Materials and methods. We examined 124 patients with suspected or significant IE (DUKE 2015) hospitalized in the Vinogradov City Clinical Hospital (2015–2021). All patients underwent parallel microbiological (cultural) and molecular biological (PCR or PCR followed by sequencing) examination of venous whole blood samples.
Results. The introduction of an early parallel PCR study into the algorithm for the etiological diagnosis of IE made it possible to obtain an additional advantage in 43/124 (34.7%) patients, which made it possible to exclude unreliable results in the determination of CoNS skin commensals and pathogens atypical for IE or contamination and identify the true pathogens, and also for the first time to isolate the etiopathogenetic pathogen with a negative microbiological study. It was shown that in IE associated with CoNS, the association with the disease was confirmed by PCR in 21.4% (3/14) and refuted in 71.4% (10/14). The coincidence of the results of microbiological and PCR studies of blood samples was obtained only in 35/95 (36.8%). Positive results of PCR analysis of blood of biological material with negative results of culture were obtained in 22/51 (43.1%), of which 2/22 (9.0%) were able to confirm the presence of Bartonella spp DNA. The presented complex algorithm made it possible to significantly increase the possibility of intravital identification of the pathogen in the blood from 58.9 to 76.6%. IE with unknown etiology was present in 29/124 (23.4%) patients. A parallel PCR study allowed timely correction of antibiotic therapy in 43/124 (34.7%) patients.
Conclusion. Expansion of indications for the use of PCR studies, primarily whole venous blood samples, is justified, not only in IE with negative results of microbiological examination, but also as a control method for the reliability of the results of traditional (cultural) diagnostic methods.
Keywords: infective endocarditis, microbiological (cultural) methods, blood culture, tissue culture, polymerase chain reaction, molecular biological methods, PCR, sequencing, etiological diagnostics
Цель. Изучение диагностического преимущества и ценности параллельного внедрения молекулярно-биологических методов (полимеразная цепная реакция – ПЦР, секвенирование) в дополнение к микробиологическому исследованию образцов цельной венозной крови при ИЭ.
Материалы и методы. Обследованы 124 пациента с достоверным или вероятным ИЭ (DUKE 2015), госпитализированных в ГБУЗ «ГКБ им. В.В. Виноградова» (2015–2021 гг.). Всем пациентам проводилось параллельное микробиологическое (культуральное) и молекулярно-биологическое (ПЦР или ПЦР с последующим секвенированием) исследования образцов цельной венозной крови.
Результаты. Внедрение раннего параллельного ПЦР-исследования в алгоритм этиологической диагностики ИЭ позволило получить дополнительное преимущество у 43/124 (34,7%) пациентов, позволившее исключить недостоверные результаты при определении комменсалов кожных покровов CoNS и нетипичных для ИЭ патогенов или контаминацию и идентифицировать истинные возбудители, а также впервые выделить этиопатогенетического возбудителя при отрицательном микробиологическом исследовании. Показано, что при ИЭ, ассоциированном с CoNS, связь с заболеванием подтверждена при ПЦР-исследовании у 21,4% (3/14) и опровергнута у 71,4% (10/14) пациентов. Совпадение результатов микробиологического и ПЦР-исследования образцов крови получено только у 35/95 (36,8%) больных. Положительные результаты ПЦР-исследования крови биологического материала при отрицательных результатах культурального исследования получены у 22/51 (43,1%) пациентов, из них у 2/22 (9,0%) удалось подтвердить наличие ДНК Bartonella spp. Представленный комплексный алгоритм позволил значительно увеличить возможность прижизненной идентификации возбудителя в крови от 58,9 до 76,6%. ИЭ с неустановленной этиологией имелся у 29/124 (23,4%) обследованных. Параллельное ПЦР-исследование позволило провести своевременную коррекцию антибактериальной терапии у 43/124 (34,7%) пациентов.
Заключение. Обоснованно расширение показаний для применения ПЦР-исследования, в первую очередь образцов цельной венозной крови, не только при ИЭ с отрицательными результатами микробиологического исследования, но и в качестве метода-контроля за достоверностью получаемых результатов традиционных (культуральных) методов диагностики.
Ключевые слова: инфекционный эндокардит, микробиологические методы диагностики, культуральное исследование, полимеразная цепная реакция, молекулярно-биологические методы, ПЦР, секвенирование, этиологическая диагностика
________________________________________________
Aim. To investigate of the diagnostic advantage and value of quantitative analysis of molecular biological methods (polymerase chain reaction – PCR, sequencing) in addition to microbiological examination of whole venous blood in IE.
Materials and methods. We examined 124 patients with suspected or significant IE (DUKE 2015) hospitalized in the Vinogradov City Clinical Hospital (2015–2021). All patients underwent parallel microbiological (cultural) and molecular biological (PCR or PCR followed by sequencing) examination of venous whole blood samples.
Results. The introduction of an early parallel PCR study into the algorithm for the etiological diagnosis of IE made it possible to obtain an additional advantage in 43/124 (34.7%) patients, which made it possible to exclude unreliable results in the determination of CoNS skin commensals and pathogens atypical for IE or contamination and identify the true pathogens, and also for the first time to isolate the etiopathogenetic pathogen with a negative microbiological study. It was shown that in IE associated with CoNS, the association with the disease was confirmed by PCR in 21.4% (3/14) and refuted in 71.4% (10/14). The coincidence of the results of microbiological and PCR studies of blood samples was obtained only in 35/95 (36.8%). Positive results of PCR analysis of blood of biological material with negative results of culture were obtained in 22/51 (43.1%), of which 2/22 (9.0%) were able to confirm the presence of Bartonella spp DNA. The presented complex algorithm made it possible to significantly increase the possibility of intravital identification of the pathogen in the blood from 58.9 to 76.6%. IE with unknown etiology was present in 29/124 (23.4%) patients. A parallel PCR study allowed timely correction of antibiotic therapy in 43/124 (34.7%) patients.
Conclusion. Expansion of indications for the use of PCR studies, primarily whole venous blood samples, is justified, not only in IE with negative results of microbiological examination, but also as a control method for the reliability of the results of traditional (cultural) diagnostic methods.
Keywords: infective endocarditis, microbiological (cultural) methods, blood culture, tissue culture, polymerase chain reaction, molecular biological methods, PCR, sequencing, etiological diagnostics
Полный текст
Список литературы
1. Habib G, Lancellotti P, Antunes MJ, et al. 2015 ESC Guidelines for the management of infective endocarditis: the Task Force for the Management of Infective Endocarditis of the European Society of Cardiology (ESC). Endorsed by: European Association for Cardio-Thoracic Surgery (EACTS), the European Association of Nuclear Medicine (EANM). Eur Heart J. 2015;36(44):3075-128. DOI:10.1093/eurheartj/ehv319
2. Демин А.А., Кобалава Ж.Д., Скопин И.И., и др. Инфекционный эндокардит и инфекция внутрисердечных устройств у взрослых. Клинические рекомендации МЗ РФ. Российский кардиологический журнал. 2022;27(10):5233 [Demin AA, Kobalava ZD, Skopin II, et al. Infectious endocarditis and infection of intracardiac devices in adults. Clinical guidelines 2021. Russian Journal of Cardiology. 2022;27(10):5233 (in Russian)]. DOI:10.15829/1560-4071-2022-5233
3. Котова Е.О., Домонова Э.А., Кобалава Ж.Д., и др. Современные тренды этиологической диагностики инфекционного эндокардита. Рациональная фармакотерапия в кардиологии. 2021;17(1):153-64 [Kotova EO, Domonova EA, Kobalava ZhD, et al. Modern trends in identification of causative agents in infective endocarditis. Rational Pharmacotherapy in Cardiology. 2021;17(1):153-64 (in Russian)]. DOI:10.20996/1819-6446-2021-02-14
4. Liesman RM, Pritt BS, Maleszewski JJ, Patel R. Laboratory diagnosis of infective endocarditis. J Clin Microbiol. 2017;55(9):2599-608. DOI:10.1128/JCM.00635-17
5. Fournier PE, Gouriet F, Casalta JP, et al. Blood culture-negative endocarditis. Medicine. 2017;47(96):8392. DOI:10.1097/MD.0000000000008392
6. Geissdorfer W, Moos V, Moter A, et al. High frequency of Tropheryma whipplei in culturenegative endocarditis. J Clin Microbiol. 2012;50(2):216-22. DOI:10.1128/JCM.05531-11
7. Miller RJ, Chow B, Pillai D, Church D. Development and evaluation of a novel fast broad-range 16S ribosomal DNA PCR and sequencing assay for diagnosis of bacterial infective endocarditis: multi-year experience in a large Canadian healthcare zone and a literature review. BMC Infect Dis. 2016;16:146. DOI:10.1186/s1287 9-016-1476-4
8. Котова Е.О., Домонова Э.А., Кобалава Ж.Д., и др. Инфекционный эндокардит неустановленной этиологии: возможности преодоления и роль микробиологистики. Кардиология. 2021;61(1):87-97 [Kotova EO, Domonova EA, Kobalava ZhD, и др. Infective Endocarditis With Unknown Etiology: Possibilities of Conquering and Role of Microbiologistics. Kardiologiia. 2021;61(1):87-97 (in Russian)]. DOI:10.18087/cardio.2021.1.n1218
9. Godfrey R, Curtis S, Schilling W, James P. Blood culture negative endocarditis in the modern era of 16S rRNA sequencing. Clin Med. 2020;20(40):412-6.
DOI:10.7861/clinmed.2019-0342
10. Kuhn C, Disque C, Muhl H, et al. Evaluation of Commercial Universal rRNA Gene PCR plus Sequencing Tests for Identification of Bacteria and Fungi Associated with Infectious Endocarditis. J Clin Microbiol. 2011;8(49):2919-23. DOI:10.1128/JCM.00830-11
11. El-Kholy AA, El-Rachidi NG, El-Enany M, et al. Impact of serology and molecular methods on improving the microbiologic diagnosis of infective endocarditis in Egypt. Infection. 2015;43(5):523-9. DOI:10.1007/s15010-015-0761-2
12. Habib G, Erba PA, Iung B, et al. Clinical presentation, aetiology and outcome of infective endocarditis. Results of the ESC-EORP EURO-ENDO (European infective endocarditis) registry: a prospective cohort study. Eur Heart J. 2019;40(39):3222-32. DOI:10.1093/eurheartj/ehz620
13. Домонова Э.А., Творогова М.Г., Подколзин А.Т., и др. Взятие, транспортировка, хранение биологического материала для ПЦР-диагностики: Методические рекомендации. М.: ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 2021 [Domonova EA, Tvorogova MG, Podkolzin AT, et al. Vziatie, transportirovka, khranenie biologicheskogo materiala dlia PTsR-diagnostiki: Metodicheskie rekomendatsii. Moscow: Central Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor, 2021 (in Russian)].
DOI:10.36233/978-5-6045286-6-2
14. Armstrong K, Kuhn TC, Dufner M, et al. The diagnostic benefit of 16S rDNA PCR examination of infective endocarditis heart valves: a cohort study of 146 surgical cases confirmed by histopathology. Clin Res Cardiol. 2021;110:332-42. DOI:10.1007/s00392-020-01678-x
15. Котова Е.О., Домонова Э.А., Караулова Ю.Л. и др. Инфекционный эндокардит: значение молекулярно-биологических методов в этиологической диагностике. Терапевтический архив. 2016;88(11):62-7 [Kotova EO, Domonova EA, Karaulova YuL, et al. Infective endocarditis: Importance of molecular biology techniques in the etiological diagnosis. Terapevticheskii Arkhiv (Ter. Arkh.). 2016;88(11):62-7 (in Russian)]. DOI:10.17116/terarkh2016881162-67
16. Данилов А.И., Алексеева И.В., Аснер Т.В., и др. Реальная практика терапии инфекционного эндокардита в РФ: промежуточные результаты исследования МАЭСТРО. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2013;15(2):18-9 [Danilov AI, Alekseeva IV, Asner TV, et al. Real practice of therapy for infective endocarditis in the Russian Federation: interim results of the MAESTRO study. Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy. 2013;15(2):18-9 (in Russian)].
17. Peeters B, Herijgers P, Beuselinck K, et al. Added diagnostic value and impact on antimicrobial therapy of 16S rRNA PCR and amplicon sequencing on resected heart valves in infective endocarditis: a prospective cohort study. Clin Microbiol Infect. 2017;23(11):888e1-5. DOI:10.1016/j.cmi.2017.06.008
18. Halavaara M, Martelius T, Jarvinen A, et al. Impact of pre-operative antimicrobial treatment on microbiological findings from endocardial specimens in infective endocarditis. Eur J Clin Microbiol Infect. 2019;38(3):497-503. DOI:10.1007/s1009 6-018-03451-5
19. Kemp M, Bangsborg J, Kjerulf A, et al. Advantages and Limitations of Ribosomal RNA PCR and DNA Sequencing for Identification of Bacteria in Cardiac Valves of Danish Patients. Open Microbiol J. 2013;7:146-51. DOI:10.2174/1874285801307010146
20. Bast A, Dohmen PM, Podbielski A, Warnke P. Rapid Microbiological Diagnostics from Explanted Heart Valves by a Multiplex PCR Assay. J Clin Microbiol. 2019;57(2):e01575-18. DOI:10.1128/JCM.01575-18
21. Kim MS, Chang J, Kim MN, et al. Utility of a Direct 16S rDNA PCR and Sequencing for Etiological Diagnosis of Infective Endocarditis. Ann Lab Med. 2017;37(6):505-10. DOI:10.3343/alm.2017.37.6.505
22. Boujelben I, Gdoura R, Hammami A. A broad-range PCR technique for the diagnosis of infective endocarditis. Braz J Microbiol. 2018;49(3):534-43. DOI:10.1016/j.bjm.2017.03.019
23. Voldstedlund M, Pedersen L, Baandrup U, et al. Broad-range PCR and sequencing in routine diagnosis of infective endocarditis. APMIS. 2008;116(3):190-8.
DOI:10.1111/j.1600-0463.2008.00942.x
2. Demin AA, Kobalava ZD, Skopin II, et al. Infectious endocarditis and infection of intracardiac devices in adults. Clinical guidelines 2021. Russian Journal of Cardiology. 2022;27(10):5233 (in Russian). DOI:10.15829/1560-4071-2022-5233
3. Kotova EO, Domonova EA, Kobalava ZhD, et al. Modern trends in identification of causative agents in infective endocarditis. Rational Pharmacotherapy in Cardiology. 2021;17(1):153-64 (in Russian). DOI:10.20996/1819-6446-2021-02-14
4. Liesman RM, Pritt BS, Maleszewski JJ, Patel R. Laboratory diagnosis of infective endocarditis. J Clin Microbiol. 2017;55(9):2599-608. DOI:10.1128/JCM.00635-17
5. Fournier PE, Gouriet F, Casalta JP, et al. Blood culture-negative endocarditis. Medicine. 2017;47(96):8392. DOI:10.1097/MD.0000000000008392
6. Geissdorfer W, Moos V, Moter A, et al. High frequency of Tropheryma whipplei in culturenegative endocarditis. J Clin Microbiol. 2012;50(2):216-22. DOI:10.1128/JCM.05531-11
7. Miller RJ, Chow B, Pillai D, Church D. Development and evaluation of a novel fast broad-range 16S ribosomal DNA PCR and sequencing assay for diagnosis of bacterial infective endocarditis: multi-year experience in a large Canadian healthcare zone and a literature review. BMC Infect Dis. 2016;16:146. DOI:10.1186/s1287 9-016-1476-4
8. Kotova EO, Domonova EA, Kobalava ZhD, и др. Infective Endocarditis With Unknown Etiology: Possibilities of Conquering and Role of Microbiologistics. Kardiologiia. 2021;61(1):87-97 (in Russian). DOI:10.18087/cardio.2021.1.n1218
9. Godfrey R, Curtis S, Schilling W, James P. Blood culture negative endocarditis in the modern era of 16S rRNA sequencing. Clin Med. 2020;20(40):412-6.
DOI:10.7861/clinmed.2019-0342
10. Kuhn C, Disque C, Muhl H, et al. Evaluation of Commercial Universal rRNA Gene PCR plus Sequencing Tests for Identification of Bacteria and Fungi Associated with Infectious Endocarditis. J Clin Microbiol. 2011;8(49):2919-23. DOI:10.1128/JCM.00830-11
11. El-Kholy AA, El-Rachidi NG, El-Enany M, et al. Impact of serology and molecular methods on improving the microbiologic diagnosis of infective endocarditis in Egypt. Infection. 2015;43(5):523-9. DOI:10.1007/s15010-015-0761-2
12. Habib G, Erba PA, Iung B, et al. Clinical presentation, aetiology and outcome of infective endocarditis. Results of the ESC-EORP EURO-ENDO (European infective endocarditis) registry: a prospective cohort study. Eur Heart J. 2019;40(39):3222-32. DOI:10.1093/eurheartj/ehz620
13. Domonova EA, Tvorogova MG, Podkolzin AT, et al. Vziatie, transportirovka, khranenie biologicheskogo materiala dlia PTsR-diagnostiki: Metodicheskie rekomendatsii. Moscow: Central Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor, 2021 (in Russian). DOI:10.36233/978-5-6045286-6-2
14. Armstrong K, Kuhn TC, Dufner M, et al. The diagnostic benefit of 16S rDNA PCR examination of infective endocarditis heart valves: a cohort study of 146 surgical cases confirmed by histopathology. Clin Res Cardiol. 2021;110:332-42. DOI:10.1007/s00392-020-01678-x
15. Kotova EO, Domonova EA, Karaulova YuL, et al. Infective endocarditis: Importance of molecular biology techniques in the etiological diagnosis. Terapevticheskii Arkhiv (Ter. Arkh.). 2016;88(11):62-7 (in Russian). DOI:10.17116/terarkh2016881162-67
16. Danilov AI, Alekseeva IV, Asner TV, et al. Real practice of therapy for infective endocarditis in the Russian Federation: interim results of the MAESTRO study. Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy. 2013;15(2):18-9 (in Russian).
17. Peeters B, Herijgers P, Beuselinck K, et al. Added diagnostic value and impact on antimicrobial therapy of 16S rRNA PCR and amplicon sequencing on resected heart valves in infective endocarditis: a prospective cohort study. Clin Microbiol Infect. 2017;23(11):888e1-5. DOI:10.1016/j.cmi.2017.06.008
18. Halavaara M, Martelius T, Jarvinen A, et al. Impact of pre-operative antimicrobial treatment on microbiological findings from endocardial specimens in infective endocarditis. Eur J Clin Microbiol Infect. 2019;38(3):497-503. DOI:10.1007/s1009 6-018-03451-5
19. Kemp M, Bangsborg J, Kjerulf A, et al. Advantages and Limitations of Ribosomal RNA PCR and DNA Sequencing for Identification of Bacteria in Cardiac Valves of Danish Patients. Open Microbiol J. 2013;7:146-51. DOI:10.2174/1874285801307010146
20. Bast A, Dohmen PM, Podbielski A, Warnke P. Rapid Microbiological Diagnostics from Explanted Heart Valves by a Multiplex PCR Assay. J Clin Microbiol. 2019;57(2):e01575-18. DOI:10.1128/JCM.01575-18
21. Kim MS, Chang J, Kim MN, et al. Utility of a Direct 16S rDNA PCR and Sequencing for Etiological Diagnosis of Infective Endocarditis. Ann Lab Med. 2017;37(6):505-10. DOI:10.3343/alm.2017.37.6.505
22. Boujelben I, Gdoura R, Hammami A. A broad-range PCR technique for the diagnosis of infective endocarditis. Braz J Microbiol. 2018;49(3):534-43. DOI:10.1016/j.bjm.2017.03.019
23. Voldstedlund M, Pedersen L, Baandrup U, et al. Broad-range PCR and sequencing in routine diagnosis of infective endocarditis. APMIS. 2008;116(3):190-8.
DOI:10.1111/j.1600-0463.2008.00942.x
2. Демин А.А., Кобалава Ж.Д., Скопин И.И., и др. Инфекционный эндокардит и инфекция внутрисердечных устройств у взрослых. Клинические рекомендации МЗ РФ. Российский кардиологический журнал. 2022;27(10):5233 [Demin AA, Kobalava ZD, Skopin II, et al. Infectious endocarditis and infection of intracardiac devices in adults. Clinical guidelines 2021. Russian Journal of Cardiology. 2022;27(10):5233 (in Russian)]. DOI:10.15829/1560-4071-2022-5233
3. Котова Е.О., Домонова Э.А., Кобалава Ж.Д., и др. Современные тренды этиологической диагностики инфекционного эндокардита. Рациональная фармакотерапия в кардиологии. 2021;17(1):153-64 [Kotova EO, Domonova EA, Kobalava ZhD, et al. Modern trends in identification of causative agents in infective endocarditis. Rational Pharmacotherapy in Cardiology. 2021;17(1):153-64 (in Russian)]. DOI:10.20996/1819-6446-2021-02-14
4. Liesman RM, Pritt BS, Maleszewski JJ, Patel R. Laboratory diagnosis of infective endocarditis. J Clin Microbiol. 2017;55(9):2599-608. DOI:10.1128/JCM.00635-17
5. Fournier PE, Gouriet F, Casalta JP, et al. Blood culture-negative endocarditis. Medicine. 2017;47(96):8392. DOI:10.1097/MD.0000000000008392
6. Geissdorfer W, Moos V, Moter A, et al. High frequency of Tropheryma whipplei in culturenegative endocarditis. J Clin Microbiol. 2012;50(2):216-22. DOI:10.1128/JCM.05531-11
7. Miller RJ, Chow B, Pillai D, Church D. Development and evaluation of a novel fast broad-range 16S ribosomal DNA PCR and sequencing assay for diagnosis of bacterial infective endocarditis: multi-year experience in a large Canadian healthcare zone and a literature review. BMC Infect Dis. 2016;16:146. DOI:10.1186/s1287 9-016-1476-4
8. Котова Е.О., Домонова Э.А., Кобалава Ж.Д., и др. Инфекционный эндокардит неустановленной этиологии: возможности преодоления и роль микробиологистики. Кардиология. 2021;61(1):87-97 [Kotova EO, Domonova EA, Kobalava ZhD, и др. Infective Endocarditis With Unknown Etiology: Possibilities of Conquering and Role of Microbiologistics. Kardiologiia. 2021;61(1):87-97 (in Russian)]. DOI:10.18087/cardio.2021.1.n1218
9. Godfrey R, Curtis S, Schilling W, James P. Blood culture negative endocarditis in the modern era of 16S rRNA sequencing. Clin Med. 2020;20(40):412-6.
DOI:10.7861/clinmed.2019-0342
10. Kuhn C, Disque C, Muhl H, et al. Evaluation of Commercial Universal rRNA Gene PCR plus Sequencing Tests for Identification of Bacteria and Fungi Associated with Infectious Endocarditis. J Clin Microbiol. 2011;8(49):2919-23. DOI:10.1128/JCM.00830-11
11. El-Kholy AA, El-Rachidi NG, El-Enany M, et al. Impact of serology and molecular methods on improving the microbiologic diagnosis of infective endocarditis in Egypt. Infection. 2015;43(5):523-9. DOI:10.1007/s15010-015-0761-2
12. Habib G, Erba PA, Iung B, et al. Clinical presentation, aetiology and outcome of infective endocarditis. Results of the ESC-EORP EURO-ENDO (European infective endocarditis) registry: a prospective cohort study. Eur Heart J. 2019;40(39):3222-32. DOI:10.1093/eurheartj/ehz620
13. Домонова Э.А., Творогова М.Г., Подколзин А.Т., и др. Взятие, транспортировка, хранение биологического материала для ПЦР-диагностики: Методические рекомендации. М.: ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 2021 [Domonova EA, Tvorogova MG, Podkolzin AT, et al. Vziatie, transportirovka, khranenie biologicheskogo materiala dlia PTsR-diagnostiki: Metodicheskie rekomendatsii. Moscow: Central Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor, 2021 (in Russian)].
DOI:10.36233/978-5-6045286-6-2
14. Armstrong K, Kuhn TC, Dufner M, et al. The diagnostic benefit of 16S rDNA PCR examination of infective endocarditis heart valves: a cohort study of 146 surgical cases confirmed by histopathology. Clin Res Cardiol. 2021;110:332-42. DOI:10.1007/s00392-020-01678-x
15. Котова Е.О., Домонова Э.А., Караулова Ю.Л. и др. Инфекционный эндокардит: значение молекулярно-биологических методов в этиологической диагностике. Терапевтический архив. 2016;88(11):62-7 [Kotova EO, Domonova EA, Karaulova YuL, et al. Infective endocarditis: Importance of molecular biology techniques in the etiological diagnosis. Terapevticheskii Arkhiv (Ter. Arkh.). 2016;88(11):62-7 (in Russian)]. DOI:10.17116/terarkh2016881162-67
16. Данилов А.И., Алексеева И.В., Аснер Т.В., и др. Реальная практика терапии инфекционного эндокардита в РФ: промежуточные результаты исследования МАЭСТРО. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2013;15(2):18-9 [Danilov AI, Alekseeva IV, Asner TV, et al. Real practice of therapy for infective endocarditis in the Russian Federation: interim results of the MAESTRO study. Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy. 2013;15(2):18-9 (in Russian)].
17. Peeters B, Herijgers P, Beuselinck K, et al. Added diagnostic value and impact on antimicrobial therapy of 16S rRNA PCR and amplicon sequencing on resected heart valves in infective endocarditis: a prospective cohort study. Clin Microbiol Infect. 2017;23(11):888e1-5. DOI:10.1016/j.cmi.2017.06.008
18. Halavaara M, Martelius T, Jarvinen A, et al. Impact of pre-operative antimicrobial treatment on microbiological findings from endocardial specimens in infective endocarditis. Eur J Clin Microbiol Infect. 2019;38(3):497-503. DOI:10.1007/s1009 6-018-03451-5
19. Kemp M, Bangsborg J, Kjerulf A, et al. Advantages and Limitations of Ribosomal RNA PCR and DNA Sequencing for Identification of Bacteria in Cardiac Valves of Danish Patients. Open Microbiol J. 2013;7:146-51. DOI:10.2174/1874285801307010146
20. Bast A, Dohmen PM, Podbielski A, Warnke P. Rapid Microbiological Diagnostics from Explanted Heart Valves by a Multiplex PCR Assay. J Clin Microbiol. 2019;57(2):e01575-18. DOI:10.1128/JCM.01575-18
21. Kim MS, Chang J, Kim MN, et al. Utility of a Direct 16S rDNA PCR and Sequencing for Etiological Diagnosis of Infective Endocarditis. Ann Lab Med. 2017;37(6):505-10. DOI:10.3343/alm.2017.37.6.505
22. Boujelben I, Gdoura R, Hammami A. A broad-range PCR technique for the diagnosis of infective endocarditis. Braz J Microbiol. 2018;49(3):534-43. DOI:10.1016/j.bjm.2017.03.019
23. Voldstedlund M, Pedersen L, Baandrup U, et al. Broad-range PCR and sequencing in routine diagnosis of infective endocarditis. APMIS. 2008;116(3):190-8.
DOI:10.1111/j.1600-0463.2008.00942.x
________________________________________________
2. Demin AA, Kobalava ZD, Skopin II, et al. Infectious endocarditis and infection of intracardiac devices in adults. Clinical guidelines 2021. Russian Journal of Cardiology. 2022;27(10):5233 (in Russian). DOI:10.15829/1560-4071-2022-5233
3. Kotova EO, Domonova EA, Kobalava ZhD, et al. Modern trends in identification of causative agents in infective endocarditis. Rational Pharmacotherapy in Cardiology. 2021;17(1):153-64 (in Russian). DOI:10.20996/1819-6446-2021-02-14
4. Liesman RM, Pritt BS, Maleszewski JJ, Patel R. Laboratory diagnosis of infective endocarditis. J Clin Microbiol. 2017;55(9):2599-608. DOI:10.1128/JCM.00635-17
5. Fournier PE, Gouriet F, Casalta JP, et al. Blood culture-negative endocarditis. Medicine. 2017;47(96):8392. DOI:10.1097/MD.0000000000008392
6. Geissdorfer W, Moos V, Moter A, et al. High frequency of Tropheryma whipplei in culturenegative endocarditis. J Clin Microbiol. 2012;50(2):216-22. DOI:10.1128/JCM.05531-11
7. Miller RJ, Chow B, Pillai D, Church D. Development and evaluation of a novel fast broad-range 16S ribosomal DNA PCR and sequencing assay for diagnosis of bacterial infective endocarditis: multi-year experience in a large Canadian healthcare zone and a literature review. BMC Infect Dis. 2016;16:146. DOI:10.1186/s1287 9-016-1476-4
8. Kotova EO, Domonova EA, Kobalava ZhD, и др. Infective Endocarditis With Unknown Etiology: Possibilities of Conquering and Role of Microbiologistics. Kardiologiia. 2021;61(1):87-97 (in Russian). DOI:10.18087/cardio.2021.1.n1218
9. Godfrey R, Curtis S, Schilling W, James P. Blood culture negative endocarditis in the modern era of 16S rRNA sequencing. Clin Med. 2020;20(40):412-6.
DOI:10.7861/clinmed.2019-0342
10. Kuhn C, Disque C, Muhl H, et al. Evaluation of Commercial Universal rRNA Gene PCR plus Sequencing Tests for Identification of Bacteria and Fungi Associated with Infectious Endocarditis. J Clin Microbiol. 2011;8(49):2919-23. DOI:10.1128/JCM.00830-11
11. El-Kholy AA, El-Rachidi NG, El-Enany M, et al. Impact of serology and molecular methods on improving the microbiologic diagnosis of infective endocarditis in Egypt. Infection. 2015;43(5):523-9. DOI:10.1007/s15010-015-0761-2
12. Habib G, Erba PA, Iung B, et al. Clinical presentation, aetiology and outcome of infective endocarditis. Results of the ESC-EORP EURO-ENDO (European infective endocarditis) registry: a prospective cohort study. Eur Heart J. 2019;40(39):3222-32. DOI:10.1093/eurheartj/ehz620
13. Domonova EA, Tvorogova MG, Podkolzin AT, et al. Vziatie, transportirovka, khranenie biologicheskogo materiala dlia PTsR-diagnostiki: Metodicheskie rekomendatsii. Moscow: Central Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor, 2021 (in Russian). DOI:10.36233/978-5-6045286-6-2
14. Armstrong K, Kuhn TC, Dufner M, et al. The diagnostic benefit of 16S rDNA PCR examination of infective endocarditis heart valves: a cohort study of 146 surgical cases confirmed by histopathology. Clin Res Cardiol. 2021;110:332-42. DOI:10.1007/s00392-020-01678-x
15. Kotova EO, Domonova EA, Karaulova YuL, et al. Infective endocarditis: Importance of molecular biology techniques in the etiological diagnosis. Terapevticheskii Arkhiv (Ter. Arkh.). 2016;88(11):62-7 (in Russian). DOI:10.17116/terarkh2016881162-67
16. Danilov AI, Alekseeva IV, Asner TV, et al. Real practice of therapy for infective endocarditis in the Russian Federation: interim results of the MAESTRO study. Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy. 2013;15(2):18-9 (in Russian).
17. Peeters B, Herijgers P, Beuselinck K, et al. Added diagnostic value and impact on antimicrobial therapy of 16S rRNA PCR and amplicon sequencing on resected heart valves in infective endocarditis: a prospective cohort study. Clin Microbiol Infect. 2017;23(11):888e1-5. DOI:10.1016/j.cmi.2017.06.008
18. Halavaara M, Martelius T, Jarvinen A, et al. Impact of pre-operative antimicrobial treatment on microbiological findings from endocardial specimens in infective endocarditis. Eur J Clin Microbiol Infect. 2019;38(3):497-503. DOI:10.1007/s1009 6-018-03451-5
19. Kemp M, Bangsborg J, Kjerulf A, et al. Advantages and Limitations of Ribosomal RNA PCR and DNA Sequencing for Identification of Bacteria in Cardiac Valves of Danish Patients. Open Microbiol J. 2013;7:146-51. DOI:10.2174/1874285801307010146
20. Bast A, Dohmen PM, Podbielski A, Warnke P. Rapid Microbiological Diagnostics from Explanted Heart Valves by a Multiplex PCR Assay. J Clin Microbiol. 2019;57(2):e01575-18. DOI:10.1128/JCM.01575-18
21. Kim MS, Chang J, Kim MN, et al. Utility of a Direct 16S rDNA PCR and Sequencing for Etiological Diagnosis of Infective Endocarditis. Ann Lab Med. 2017;37(6):505-10. DOI:10.3343/alm.2017.37.6.505
22. Boujelben I, Gdoura R, Hammami A. A broad-range PCR technique for the diagnosis of infective endocarditis. Braz J Microbiol. 2018;49(3):534-43. DOI:10.1016/j.bjm.2017.03.019
23. Voldstedlund M, Pedersen L, Baandrup U, et al. Broad-range PCR and sequencing in routine diagnosis of infective endocarditis. APMIS. 2008;116(3):190-8.
DOI:10.1111/j.1600-0463.2008.00942.x
Авторы
Е.О. Котова*1,2, Э.А. Домонова3, Ж.Д. Кобалава1,2, А.Ю. Моисеева1, А.С. Писарюк1,2, О.Ю. Сильвейстрова3, Ю.Л. Караулова1,2, В.Г. Акимкин3
1 ФГАОУ ВО «Российский университет дружбы народов», Москва, Россия;
2 ГБУЗ «Городская клиническая больница им. В.В. Виноградова» Департамента здравоохранения г. Москвы, Москва, Россия;
3 ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия
*mauschen@inbox.ru
1 People’s Friendship University of Russia (RUDN University), Moscow, Russia;
2 Vinogradov City Clinical Hospital, Moscow, Russia;
3 Central Research Institute of Epidemiology, Moscow, Russia
*mauschen@inbox.ru
1 ФГАОУ ВО «Российский университет дружбы народов», Москва, Россия;
2 ГБУЗ «Городская клиническая больница им. В.В. Виноградова» Департамента здравоохранения г. Москвы, Москва, Россия;
3 ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия
*mauschen@inbox.ru
________________________________________________
1 People’s Friendship University of Russia (RUDN University), Moscow, Russia;
2 Vinogradov City Clinical Hospital, Moscow, Russia;
3 Central Research Institute of Epidemiology, Moscow, Russia
*mauschen@inbox.ru
Цель портала OmniDoctor – предоставление профессиональной информации врачам, провизорам и фармацевтам.